Em Portugal, o primeiro registo no EMAS data de 2000. De 2003 a 2008, verificou-se uma grande evolução no número de novos registos nacionais, com 18 novos registos em 2005. Desde essa data que o número anual de registos tem decrescido e aumentado o número de cancelamentos.
Em 2017, ocorreram dois novos registos e dois cancelamentos, perfazendo 54 organizações registadas no EMAS em Portugal.
Importa referir que o EMAS permite o registo coletivo, isto é, permite fazer um único registo da totalidade ou de um conjunto de locais de atividade de uma determinada organização.
Assim, embora os registos nacionais tenham apresentado, nos últimos anos um decréscimo, verifica-se que, no que se refere aos locais de atividade, este decréscimo não é tão significativo. Este facto é explicado por uma tendência de registos coletivos, bem como pelo acréscimo de novos locais de atividade por parte de organizações já registadas. No entanto, em 2017, verificou-se um decréscimo mais acentuado, tendo em conta que um dos registos cancelados tinha associados 21 locais de atividade.
